Après l'élimination d'Ansem; nos 3 amis parviennent à refermer la porte des Ténèbres et s'en vont a la recherche de Riku et du Roi Mickey. Nos 3 amis arriverent donc dans le mystérieux Manoir Oblivion, là où ils font la connaissance Du XIIIOrdre un lieu où certains souvenirs s'effacnt pour faire place a d'autres, enfoui profondémment dans notre coeur. À la suite du combat contre Marluxia, Sora fut endormi par Naminé dans une fleur de verre ainsi que Donald et Dingo. Ils finissent par se réveillée dans un ancien Manoir abandonné dans la paysible petite Cité du Crépuscule, où ils font la connaissance d'Hayner, Pence et Olette ainsi que d'étranges créatures, inconnues jusqu' èa ce jour. En quète d'information, nos 3 héros finissent par se retrouver dans la Tour de Yen-Sid, ancien Maitre du Roi. Il leur explique que leur nouveau ennemis se nomment Simili. Ainsi, nos 3 amis partent a la reche de Riku et du Roi Mickey. Mais, en chemin, ils vont croisés cette mystérieuse Organisation XIII, ainsi que ce jeune homme que Sora connais si bien...
